НАНОМАНИПУЛИРОВАНИЕ БИОМАКРОМОЛЕКУЛАМИ И МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ КОМПАКТИЗАЦИИ ДНК

Лиманская О.Ю. , Лиманский А.П. (2011) НАНОМАНИПУЛИРОВАНИЕ БИОМАКРОМОЛЕКУЛАМИ И МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ КОМПАКТИЗАЦИИ ДНК. Журнал Національної академії медичних наук України, т.17 (№4). с. 313-329.

[img]
Перегляд
Text
Pages from obj 2011 tom 17 #4-313.pdf

Download (1274Kb) | Перегляд
Офіційний URL: www.amnu.gov.ua

Резюме

Представлены экспериментальные результаты исследований внутримолекулярной компактизации единичных молекул ДНК при иммобилизации на субстрате под влиянием его поверхностных свойств. На основе данных атомно-силовой микроскопии доказано, что ДНК представляет собой своеобразную молекулярную пружину — молекула ДНК может быть не только вытянута, но и сжата. На модифицированной аминослюде наряду с плектонемично суперспиральными молекулами ДНК были визуализированы единичные молекулы с чрезвычайно высоким уровнем компактизации, степень суперспирализации которых значительно выше по сравнению с ранее достигнутыми экспериментально и рассмотренными теоретически. Расстояние между нуклеотидами вдоль оси спирали для таких суперспиральных молекул ДНК изменялось в диапазоне от 1,94 Å до 2,19 Å. Такие сжатые суперспиральные молекулы ДНК с уменьшенным межнуклеотидным расстоянием по сравнению с известными формами ДНК были отнесены к новой форме ДНК — суперспиральной ДНК. Визуализацией линейных и суперспиральных молекул ДНК на четырех разных субстратах с разными поверхностными свойствами доказано, что сжатие суперспиральных молекул ДНК обусловлено поверхностными свойствами субстрата — высокой гидрофобностью и плотностью заряда модифицированной аминослюды. Визуализированы этапы компактизации единичных молекул суперспиральной ДНК pGEMEX, иммобилизованных на модифицированной аминослюде. Показано, что компактизация единичных молекул происходит в три этапа последовательного складывания пополам с уменьшением длины оси суперспирали, т. е. с образованием осей суперспирали второго и третьего порядка. Компактизация единичных молекул завершается образованием молекул в сферической конформации. Предложена модель возможных конформационных переходов суперспиральной ДНК in vitro в отсутствие протеинов при возрас тании уровня компактизации.

Тип елементу : Стаття
Додаткова інформація: УДК 577.2: 577.32
Ключові слова: суперспиральная ДНК, атомно-силовая микроскопия, компактизация ДНК,адсорбция ДНК, аминослюда, сверхсуперспирализация.
Теми: 4. Медицина праці > 4.4. Теоретична медицина
Організація-джерело ресурсу: Наукові установи України > Національна академя медичних наук України
Назва організації: Государственное учреждение “Институт микробиологии и иммунологии им. И. И. Мечникова НАМН Украины”, 61057 Ха, Национальный научный центр “Институт экспериментальной и клинической ветеринарной медицины” НААН Украины, 61023 Харьков
Видавець: НАМН України
Останні зміни: 02 Лип 2014 09:06
URI: http://opb.org.ua/id/eprint/69

Дії, що потребують авторизації

Перегляд елементу Перегляд елементу